引言

1.1 软件基本信息

全称为“浙大单细胞高通量测序二聚体检测软件”，简称“SoCube” [soʊ'kjuːb]，版本号V1.1。SoCube V1.1是使用Python编写的无可视化用户操作页面（GUI）的终端命令式软件，可以运行于任何可运行Python语言的计算服务器、个人计算机等。

1.2 编写目的

《浙大单细胞高通量测序二聚体检测软件（V1.1）用户手册》（以下简称“本手册”）是为浙大单细胞高通量测序二聚体检测软件（V1.1）的用户使用指导手册。

1.3 软件开发背景

高通量单细胞RNA测序（single-cell RNA sequencing, scRNA-seq）被广泛应用在生物医学研究中[1-6]。但由于测序技术的限制，测序过程中会产生由两个（或多个）细胞结合而成的二聚体（或多聚体）。二聚体相当于一种本不存在于样本中的细胞类型，会严重干扰细胞与基因的真实统计分布，进而影响具有分布依赖性的下游研究[7]。因此，浙江大学创新药物研究与生物信息学实验室（以下简称“我们”）开发了SoCube用于检测单细胞高通量测序产生的二聚体。